重庆方面先是肯定了秦晋的抗争精神和积极投身战斗的功绩，接着才是要求秦晋务必保住闽川铁路控制权，为全国抗击日本侵略者捍卫住最后的一条出海生命线。
同时大权一放，确定了秦晋对苏浙沪闽赣粤五省一市的合法军事行动权，调整原东南战区为南部战区，由秦晋担任南部战区司令长官。
下辖102集团军，广州备倭军，粤18，19，20军，赣143，144，145，146守备师，浙268，269，，270，271守备师，以及苏留守13，14卫戍旅。
全战区共辖1个中央嫡系集团军12万人，4个地方军8万人，8个守备师14万人，2个卫戍旅18000人。共计36万常备主辅兵力。
而上海方面则给的更高，直接欲任命他为伪政府三军总司令官，全权辖制两广，两湖，赣闽浙六省，有权调动华北，华中，华南，以及内陆地区的一切伪军事力量。
同时愿意任命他为政府二把手，全权负责对内军事一切事务。
这份权力和头衔不可谓不大，可这样原则上的事情，秦晋连选都不能选，在第一时间就明电宣布坚决支持一个国家，拥护重庆政府为国家唯一合法政府，无条件服从来自重庆政府下达的军事命令。
并且于25日正式就任南部五省一市军政一把手，以一级上将的身份出身任南部战区最高军事司令官。
一时间，泉州门庭若市，威尔士代表国联向秦晋发去贺电，其他国家代表也亲自到场出席秦晋的就任仪式。
而秦晋就任后的第一件事就是以官方的身份，将在南京收集的日本军队罪证以照片，录像，证物的形式公之于众，以南部战区司令官的名义对日军松井石根为首的213名军队军事主官下达追杀令。
同时对日本政府代表松本三郎等政府官员执行制裁措施。
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